A-modul, Forår 2004, 10 ECTS, taught yearly
(i 2004 skal biologistuderende tage dette kursus sammen med molekylær evolution i F1 kvarter)Målsætning
At belyse hvordan DNA-sekvenser kan benyttes til at undersøge evolutionære processer i populationer. Populationsgenetik vil blive gennemgået som fundament for forståelsen af disse processer.
Indhold
Kurset vil præsentere en række metoder, som dernæst diskuteres ved læsning af originalartikler. Indenfor klassisk populationsgenetik gennemgås tilfældig genetisk drift, selektion på variation i et eller flere loci, samt selektion-mutationsbalance.
Analyse af data diskuteres udfra The Coalescent, som giver en statistisk beskrivelse af observeret variation.
Basal coalescent-teori gennemgås og effekter af mutation, rekombination, immigration, populationsstruktur og selektion diskuteres.
Eksempler på dataanalyse bygger over SNP-, mikrosatellit- og sekvensanalyse. Emnerne er både generelle, såsom detektion af rekombination og genkonversion i nukleære sekvenser og effekter af selektion, hybridisering og introgression, og mere specielle eller anvendelsesorienterede, såsom anvendelse af molekylær variation i retsgenetik og til lokalisering og identifikation af sygdomsgener. Endelig analyseres menneskets genom udfra et populationsgenetisk synspunkt.
Computere anvendes både til visualisering af modeller og til dataanalyse.
Form og omfang
4 timers forelæsninger, 3 timers teoretiske øvelser og computerøvelser, samt 2 timers kollokvier ugentligt i 7 uger.
Forudsætninger
Molekylær Evolution.
Obl. program
Kollokvier.
Lærebog
J. Hein, M. H. Schierup og C. Wiuf: “Sequence variation, Genealogies and Evolution,” F. B. Christiansen: “Lecture Notes in Population Genetics,” samt udleverede artikler.
Lærere
Mikkel Schierup og Freddy Christiansen.
Evaluering
Mundtlig eksamen. Ekstern censur, 13-skala.