Formålet med kurset er at give et indblik i de grundlæggende begreber inden for bioinformatik. Kurset sigter desuden på at give de studerende en forståelse for bioinformatikkens placering i sammenhæng med biologi, molekylær biologi,
statistik og datalogi. Praktiske færdigheder i brug af bioinformatiske værktøjer opøves gennem computerøvelser.
Sammenligning af to eller flere sekvenser (alignment), substitutionsmodeller, dynamisk programmering
Metoder til søgning i sekvensdatabaser.
Konstruktion af evolutionære træer
RNA sekundær strukturforudsigelse
Protein-struktur og protein-funktions forudsigelse
Eksperimentel bioinformatik
Statistisk modellering af det enkelte molekyle og molekylær dynamik
Metabolske og regulatoriske netværk
At den studerende har fulgt kurserne i Almen Biologi, Molekylærbiologi I (Almen Biokemi og Almen Molekylærbiologi) på Nanostudiet.
Opgives senere
3 timers forelæsning/uge og 3 timers øvelser/uge (2 uger med TØ med opgaver og
artikellæsning, 5 uger med computerøvelser)
Godkendelse af rapporter over computerøvelser. Desuden afholdes mundtlig eksamen
(30 min.) uden forberedelse efter 13 skalaen med ekstern censur.
Kursusansvarlig: Leif Schauser
Undervisere: Leif Schauser, Christian Storm, Mikkel Schierup
5 ECTS
Kurset forløber over et kvarter og det udbydes i fjerde kvarter (om foråret).