Biodiversitets informatik

Biodiversitets Informatik


C-modul, Forår, 1 point, 5 ECTS

Målsætning
I det globale videnssamfund stilles der stadig større krav til håndtering, filtrering, og formidling af store datamængder, herunder opbyggelsen af internetbaserede søgesystemer og analytiske værktøjer. Med udgangspunkt i biodiversitetsdata vil dette kursus give en grundlæggende forståelse for de forskellige elementer der indgår i sådanne systemer (databaser, ekspertsystemer, hjemmesider), samt en praktisk færdighed i opbygning og publikation af database-baserede web-sites.

Indhold
Kurset gennemføres som en række 4-timers computerøvelser.. Den første del af kurset omhandler primært database-forståelse, dvs. principper for organisation og struktur af data, datasøgning, og database-baserede ekspertsystemer. I anden del af kurset fokuseres på web-værktøjer til publikation af interaktive databaser samt praktisk konstruktion af hjemmesider. I den sidste del af kurset integreres disse færdigheder gennem et selvstændigt projektarbejde, hvor der opbygges et biodiversitetsorienteret website hvorfra der kan søges i underliggende databaser. Det konkrete indhold af dette website er op til den enkelte studerende, og kan fx være taksonomisk, biogeografisk eller økologisk. Der kan arbejdes med egne data. Eksempler på allerede eksisterende søgesystemer er bl.a. MYCOKEY »http://www.mycokey.com«, GENBANK »http://www.ncbi.nlm.nih.gov« , CABI BIOSCIENCE »http://194.131.255.3/cabipages« og W3TROPICOS »http://mobot.mobot.org/W3T/Search/vast.html«.

Form og omfang
4 Lø per uge i 11 uger.

Obligatorisk program
Hele kurset.

Lærebog
Internet og udleveret materiale.

Lærere
Jens H. Petersen (jens.h.petersen@biology.au.dk) samt NN.

Evaluering
Godkendelse efter forsvar af projekt.

Bemærkninger
Maksimalt 16 deltagere.