C-modul, Forår, 1 point, 5 ECTS
Målsætning
Genomsekvensprojekter af modelorganismer har identificeret mange nye gener af ukendt funktion. Kurset vil give et overblik over forskellige eksperimentelle tilgange til at belyse disse geners funktion.
Indhold
Kurset starter med en gennemgang af basale teknikker i genomanalyse såsom kortlægning, samt klonings- og sekventeringsstrategier. Derefter gennemgår vi nogle eksempler på færdigsekventerede genomer af modelorganismer, og hvilke konklusioner der kan drages af disse. Hovedvægten af kurset ligger i beskrivelsen af en række eksperimentelle design til afdækning af genfunktioner, som tager udgangspunkt i sekvensinformation af genomer, cDNAer samt proteiner. Anvendelsesmulighederne inden for bioteknologi og medicin vil også blive belyst.
Følgende emner diskuteres i kursets forløb:
1) Introduktion til genomanalyse (Kortlægning EST m.fl.).
2) Computeranalytisk værktøj til sekvensanalyse (BLAST, GENFINDER).
3) DNA microchip technology ("Genome wide expression analysis").
4) Mutagenese-strategier: "Gene replacement", kemisk mutagenese.
5) "Transposon tagging", "gene traps".
6) Proteinnetværk: "Yeast two-hydrid system".
7) Proteomics (2D-PAGE, tandem mass spectrometry).
8) Anvendelse inden for bioteknologi og medicin.
Form og omfang
Tre sammenhængende timer pr. uge i 10 uger fordelt med ca. to timers gruppediskussion og ca. en times forelæsning som introduktion til den følgende uges emne.
Obl. program
Hele kurset.
Forudsætninger
Molekylær Biologi A.
Lærebøger
Originallitteratur.
Lærere
Leif Schauser, evt. gæsteforelæsere.
Prøveform
Bestået/Ikke-bestået på grundlag af 80% registreret fremmøde.
Bemærkninger
Max. 24 deltagere.