Målsætning
- at give praktisk erfaring i at opstille og anvende computermodeller af biologiske processer udfra måledata samt hypoteser for problemstillingen.
- at evaluere de opstillede modeller med henblik på stabilitet, tilgrundeliggende antagelser samt implikationer for fremtidige eksperimenter.
- at give forståelse for fordele og problemer ved computermodellering.
Indhold
Vi vil i kurset anvende en brugervenlig simuleringsprogrampakke STELLA til demonstration
af forskellige modelleringsteknikker for at belyse:
1) hvordan man konstruerer en numerisk
model for forskellige slags biologiske processer,
2) hvordan en sådan model implementeres i
en computersimulering,
3) hvordan man tolker resultatet,
4) hvordan man kan udnytter modellen til at designe nye forsøg der måler de afgørende parametre for den biologiske
proces. Kurset starter med en hurtig gennemgang af STELLA som udleveres til alle
deltagerne. Derefter vil forskellige biologiske problemstillinger blive introduceret og vi vil diskutere hvordan den pågældende problemstilling kan implementeres i STELLA. Deltagerne skal derefter lave en kvantitativ computersimulering af hver proces udfra de opgivne data. Resultaterne af disse simuleringer vil blive diskuteret under øvelsesgangene. Tre af disse modeller og tilhørende dokumentation skal afleveres og resultatet godkendes for at bestå kurset.
Undervisningsform og omfang
2x2 timers øvelser ugentligt (med integrerede forelæsninger og computersimulationer) i 6 uger
Obl. program
Deltagelse i øvelser.
Forudsætninger
Der kræves minimalt forhåndskendskab til computere samt bestået Matematik Alfa 1 eller Matematik A.
Litteratur
Udleverede computer-manualer, programmel, noter og artikler.
Lærer
Niels Birger Ramsing
Prøveform
Aflevering af tre modeller/rapporter der alle skal godkendes for at kurset er bestået.
Antal deltagere
Maksimalt 12.